2005年2月9日
宮崎県版レッドデータブック 宮崎県の保護上重要な野生生物
維管束植物
| 県カテゴリー | 重要度 | 和名 | 科名 | 学名 | 環境省カテゴリー |
|---|---|---|---|---|---|
| 絶滅 | C | ユノミネシダ | コバノイシカグマ科 | HiSTiOpTERiS incisa | − |
| 絶滅 | B | ヒュウガトラノオ | チャセンシダ科 | Asplenium wilfordii x yoshinagae | |
| 絶滅 | A | アツイタ | ツルキジノオ科 | Elaphoglossum yoshinagae | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅 | B | ミイケイワヘゴ | オシダ科 | Dryopteris x miyazakiensis | |
| 絶滅 | B | キリシマワカナシダ | オシダ科 | Dryopteris x pseudo-commixta | |
| 絶滅 | B | アオグキイヌワラビ | イワデンダ科 | ATHYRIUM VIRIDESCENTIPES | |
| 絶滅 | B | オオヒメワラビモドキ | イワデンダ科 | Deparia unifurcata | |
| 絶滅 | A | ホコザキウラボシ | ウラボシ科 | Microsorium dilatatum | |
| 絶滅 | B | デンジソウ | デンジソウ科 | MARSILEA QUADRIｆOLIA | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅 | A | ソハヤキミズ | イラクサ科 | Pilea sohayakiensis | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅 | A | ヤナギヌカボ | タデ科 | Persicaria foliosa var.paludicola | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅 | A | オオヤマカタバミ | カタバミ科 | Oxalis obtriangulata | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅 | B | ヒメビシ | ヒシ科 | Trapa incisa | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅 | A | タチモ | アリノトウグサ科 | Myriophyllum ussuriense | 準絶滅危惧 |
| 絶滅 | B | ウラジロウコギ | ウコギ科 | Acanthopanax hypoleucus | |
| 絶滅 | A | アサザ | ミツガシワ科 | Nymphoides peltata | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅 | A | シマスナビキソウ（タイワンルリソウ） | ムラサキ科 | Cynoglossum lanceolatum var.formosanum | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅 | B | ムラサキ | ムラサキ科 | Lithospermum erythrorhizon | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅 | B | スナビキソウ | ムラサキ科 | Messerschmidia sibirica | |
| 絶滅 | B | カイジンドウ | シソ科 | Ajuga ciliata var.villosior | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅 | B | オオアブノメ | ゴマノハグサ | Gratiola japonica | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅 | A | タチミゾカクシ | キキョウ科 | Lobelia hancei | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅 | B | ブクリョウサイ | キク科 | Dichrocephala integrifolia | |
| 絶滅 | A | ヒゴタイ | キク科 | Echinops setifer | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅 | A | ムジナノカミソリ | ヒガンバナ科 | Lycoris sanguinea var.koreana | 絶滅 |
| 絶滅 | A | ミズアオイ | ミズアオイ科 | Monochoria korsakowii | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅 | A | ヒュウガホシクサ | ホシクサ科 | Eriocaulon seticuspe | 絶滅 |
| 絶滅 | C | ケタガネソウ | カヤツリグサ科 | Carex ciliato-marginata | |
| 絶滅 | A | キンセイラン | ラン科 | Calanthe nipponica | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅 | B | カゴメラン | ラン科 | Goodyera hachijoensis var. matsumurana | |
| 野生絶滅 | A | サツマシダ | オシダ科 | Ctenitis sinii | 絶滅危惧1B類 |
| 野生絶滅 | A | ヒュウガシケシダ | イワデンダ科 | Deparia minamitanii | 絶滅危惧1A類 |
| 野生絶滅 | A | ミチノクフクジュソウ | キンポウゲ科 | Adonis multifiora | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | ヒノタニリュウビンタイ | リュウビンタイ科 | Angiopteris fokienssis | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | ヒロハアツイタ | ツルキジノオ科 | Elaphoglossum tosaense | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | コバヤシカナワラビ（芹沢新称） | オシダ科 | Arachniodes sp. | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | イイノカナワラビ | オシダ科 | Arachniodes x mirabilis | |
| 絶滅危惧1A類 | A | クマイワヘゴ | オシダ科 | Dryopteris anthracinisquama | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | キリシマイワヘゴ | オシダ科 | Dryopteris hangchowwnsisi | 準絶滅危惧 |
| 絶滅危惧1A類 | B | テツヤマイノデ | オシダ科 | Polystichum x tetsuyamense | |
| 絶滅危惧1A類 | A | アソシケシダ | イワデンダ科 | Deparia otomasui | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | ヒロハヒメウラボシ | ヒメウラボシ科 | Grammitis nipponica | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | C | ネズ | ヒノキ科 | Juniperus rigida | |
| 絶滅危惧1A類 | C | ヒメハマナデシコ | ナデシコ科 | Dianthus kiusianus | |
| 絶滅危惧1A類 | A | アラゲサンショウソウ | イラクサ科 | Pellionia brevifolia | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | ワダソウ | ナデシコ科 | Pseudostellaria heterophylla | |
| 絶滅危惧1A類 | A | コウライトモエソウ | オトギリソウ科 | Hypericum ascyron var.longistylum | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | フッキソウ | ツゲ科 | Pachysandra terminalis | |
| 絶滅危惧1A類 | B | タチカモメヅル | ガガイモ科 | Cynanchum nipponicum var.glabrum | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ホソバニセジュズネノキ | アカネ科 | Damnacanthus indicus var.lancifolius | |
| 絶滅危惧1A類 | B | イガホオズキ | ナス科 | Physaliastrum japonicum | |
| 絶滅危惧1A類 | B | アオホオズキ | ナス科 | Physaliastrum savatieri | 情報不足 |
| 絶滅危惧1A類 | B | ヤマホオズキ | ナス科 | Physalis chamaesarachoides | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | C | ハマウツボ | ハマウツボ科 | Orobanche coerulescens | |
| 絶滅危惧1A類 | B | ツルギキョウ | キキョウ科 | Campanumoea maximowiczii | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | C | バンジンガンクビソウ（コバナガンクビソウ） | キク科 | Carpesium faberi | |
| 絶滅危惧1A類 | C | ホクチアザミ | キク科 | Saussurea gracilis | |
| 絶滅危惧1A類 | B | ヒメヒゴタイ | キク科 | Saussurea pulchella | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | ウエマツソウ | ホンゴウソウ科 | Sciaphila tosaensis | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | トリゲモ | イバラモ科 | Najas minor | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | タヌキノショクダイ | ヒナノシャクジョウ科 | Glaziocharis abei | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | キリシマタヌキノショクダイ | ヒナノシャクジョウ科 | Glaziocharis tuberculata | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | キシュウナキリスゲ | カヤツリグサ科 | Carex nachiana | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | ヒナラン | ラン科 | Amitostigma gracile | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | ユウシュンラン | ラン科 | Cephalanthera erecta var.subaphylla | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | アキザキナギラン | ラン科 | Cymbidium javanicum var.aspidistrifolium | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | カンラン | ラン科 | Cymbidium kanran | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | ニイタカチドリ | ラン科 | Platanthera brevicalcarata | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ナヨテンマ | ラン科 | Gastrodia gracilis | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | ヒメフタバラン | ラン科 | Listera japonica | |
| 絶滅危惧1A類 | B | コオロギラン | ラン科 | Stigmatodactylus sikokianus | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | シナミズニラ | ミズニラ科 | Isoetes sinensis var.sinensis | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | オオバシナミズニラ | ミズニラ科 | Isoetes sinensis var.coreana | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | シンエダウチホングウシダ | ホングウシダ科 | Lindsaea commixta | |
| 絶滅危惧1A類 | C | ホングウシダ | ホングウシダ科 | Lindsaea odorata | |
| 絶滅危惧1A類 | B | キクシノブ | シノブ科 | Humata repens | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | タキミシダ | シシラン科 | Antrophyum obovatum | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | クマガワイノモトソウ | イノモトソウ科 | Pteris deltodon | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | ホコシダ | イノモトソウ科 | Pteris ensiformis | − |
| 絶滅危惧1A類 | B | ヒカゲアマクサシダ | イノモトソウ科 | Pteris tokioi | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ホコガタシダ | チャセンシダ科 | Asplenium ensiforme | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | テンリュウヌリトラノオ | チャセンシダ科 | Asplenium normale var.shimurae | − |
| 絶滅危惧1A類 | A | ヘツカシダ | ツルキジノオ科 | Bolbitis subcordata | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ヒュウガカナワラビ | オシダ科 | Arachniodes hiugana | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | ホソバヤブソテツ | オシダ科 | Cyrtomium hookerianum | |
| 絶滅危惧1A類 | A | エビノオオクジャク（未発表種） | オシダ科 | Dryoteris ebinoensis nom.nud. | |
| 絶滅危惧1A類 | B | アイイヌタマシダ | オシダ科 | Dryopteris x yamashitae | |
| 絶滅危惧1A類 | C | ミゾシダモドキ | ヒメシダ科 | Cyclogramma leveillei | |
| 絶滅危惧1A類 | B | サトメシダ | イワデンダ科 | Athyrium deltoidofrons | |
| 絶滅危惧1A類 | B | ミドリワラビ | イワデンダ科 | Deparia viridifrons | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ニチナンヒロハノコギリシダ（南谷、高宮新称） | イワデンダ科 | Diplazium sp. | |
| 絶滅危惧1A類 | B | キンモウワラビ | イワデンダ科 | Hypodematium crenatum | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | イワデンダ | イワデンダ科 | Ｗoodsia polystichoides | |
| 絶滅危惧1A類 | B | アカウキクサ | アカウキクサ科 | Azolla imbricata | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | スギ（自生） | スギ科 | Cryptomeria japonica | |
| 絶滅危惧1A類 | B | ヒノキ（自生） | ヒノキ科 | Chamaecyparis obtusa | |
| 絶滅危惧1A類 | B | ノグルミ | クルミ科 | Platycarya strobilacea | |
| 絶滅危惧1A類 | B | アカソ | イラクサ科 | Boehmeria sylvestris | |
| 絶滅危惧1A類 | A | キュウシュウツチトリモチ | ツチトリモチ科 | Balanophara kiusiana | |
| 絶滅危惧1A類 | A | チョクザキミズ | イラクサ科 | Lecanthus peduncularis | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | クリンユキフデ | タデ科 | Bistorta suffulta | |
| 絶滅危惧1A類 | B | サイコクヌカボ | タデ科 | Persicaria foliosa var.nikaii | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | ナガバノウナギツカミ | タデ科 | Persicaria hastato-sagittata | |
| 絶滅危惧1A類 | A | サデクサ | タデ科 | Persicaria maackiana | |
| 絶滅危惧1A類 | B | ハママツナ | アカザ科 | Suaeda maritima | |
| 絶滅危惧1A類 | A | マツモトセンノウ（ツクシマツモト） | ナデシコ科 | Lychnis sieboldii | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | シナクスモドキ | クスノキ科 | Cryptocarya chinensis | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | ハナカズラ | キンポウゲ科 | Aconitum ciliare | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | フクジュソウ | キンポウゲ科 | Adonis ramosa. | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | ヤマオダマキ | キンポウゲ科 | Aquilegia buergeriana | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ヤマハンショウヅル | キンポウゲ科 | Clematis crassifolia | |
| 絶滅危惧1A類 | A | カザグルマ | キンポウゲ科 | Clematis patens | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | ノカラマツ | キンポウゲ科 | Thalictrum simplex var.brevipes | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | タマカラマツ | キンポウゲ科 | Thalictrum watanabei | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | モミジカラマツ | キンポウゲ科 | Trautvetteria japonica | |
| 絶滅危惧1A類 | A | オオゴカヨウオウレン | キンポウゲ科 | Coptis quinquefolia var. ramosa | |
| 絶滅危惧1A類 | B | ヤチマタイカリソウ（ヒゴイカリソウ） | メギ科 | Epimedium grandiflorum | |
| 絶滅危惧1A類 | A | シオミイカリソウ | メギ科 | Epimedium trifoliatobinatum ssp.maritimum | |
| 絶滅危惧1A類 | B | ヒメイカリソウ | メギ科 | Epimedium x youngianum | |
| 絶滅危惧1A類 | B | ジュンサイ | スイレン科 | Brasenia schreberi | |
| 絶滅危惧1A類 | A | オニバス | スイレン科 | Euryale ferox | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | クワイバカンアオイの一種（ヒュウガカンアオイ）（新称） | ウマノスズクサ科 | Heterotropa hiugana nom.nud. | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | ツクシアオイ | ウマノスズクサ科 | Heterotropa kiusiana | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | オナガカンアオイ | ウマノスズクサ科 | Heterotropa minamitaniana | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | ベニバナヤマシャクヤク | ボタン科 | Paeonia obovata | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | ヤマブキソウ | ケシ科 | Hylomecon japonicum | |
| 絶滅危惧1A類 | A | タカチホガラシ | アブラナ科 | Cardamine kiusiana | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | コウヤミズキ | マンサク科 | Corylopsis glabrescens | |
| 絶滅危惧1A類 | B | シラヒゲソウ | ユキノシタ科 | Parnassia foliosa | |
| 絶滅危惧1A類 | A | モミジセンダイソウ | ユキノシタ科 | Saxifraga sendaica f.laciniata | |
| 絶滅危惧1A類 | A | チョウセンキンミズヒキ | バラ科 | Agrimonia coreana | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | クサボケ | バラ科 | Chaenomeles japonica | |
| 絶滅危惧1A類 | B | シモツケソウ | バラ科 | Ｆilipendula multijuga | |
| 絶滅危惧1A類 | A | シコクシモツケソウ | バラ科 | Ｆilipendula tsuguwoi | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | ノカイドウ | バラ科 | Malus spontanea | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | ツチグリ | バラ科 | Potentilla discolor | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | テリハキンバイ | バラ科 | Potentilla riparia | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ツクシムレスズメ | マメ科 | Sophora franchetiana | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | フジキ | マメ科 | Cladrastis platycarpa | |
| 絶滅危惧1A類 | A | アカササゲ | マメ科 | Vigna vexillata var. tsusimensis | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | イヨフウロ | フウロソウ科 | Geranium shikokianum | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ミツバフウロ | フウロソウ科 | Geranium wilfordii | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ヒュウガタイゲキ | トウダイグサ科 | Euphorbia watanabei ssp.minamitanii | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | オオヨドカワゴロモ | カワゴケソウ科 | Hydrobryum koribanum | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | アオツリバナ | ニシキギ科 | Euonymus yakushimensis | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | ヒナノキンチャク | ヒメハギ科 | Polygalata tarinowii | 情報不足 |
| 絶滅危惧1A類 | B | ツゲ | ツゲ科 | Buxus microphylla var.japonica | |
| 絶滅危惧1A類 | A | キビノクロウメモドキ | クロウメモドキ科 | Rhamnus yoshinoi | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | ボンテンカ | アオイ科 | Urena sinuata | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ヒュウガスミレ（南谷新称） | スミレ科 | Viola sp. | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ツチビノキ | ジンチョウゲ科 | Daphnimorpha capitellata | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | キスミレ | スミレ科 | Viola orientalis | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | ホソバシロスミレ | スミレ科 | Viola patrinii f. angustifolia | |
| 絶滅危惧1A類 | A | タチスミレ | スミレ科 | Viola raddeana | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | アケボノスミレ | スミレ科 | Viola rossii | |
| 絶滅危惧1A類 | B | ヒカゲスミレ | スミレ科 | Viola yezoensis | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ミズスギナ | ミソハギ科 | Rotala hippuris | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | トダイアカバナ | アカバナ科 | Epilobium formosanum | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | ミヤマニガウリ | ウリ科 | Schizopepon bryoniaefolius | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ミズキンバイ | アカバナ科 | Ludwigia stipulacea | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | オグラノフサモ | アリノトウグサ科 | Myriophyllum oguraense | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | ヨロイグサ | セリ科 | Angelica dahurica | |
| 絶滅危惧1A類 | A | オオウバタケニンジン | セリ科 | Angelica mukabakiensis | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | ホタルサイコ | セリ科 | Bupleurum longiradiatum | |
| 絶滅危惧1A類 | B | ミシマサイコ | セリ科 | Bupleurum scorzoneraefolium var.stenophyllum | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | ヌマゼリ | セリ科 | Sium suave var. nipponicum | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | マルバイチヤクソウ | イチヤクソウ科 | Pyrola nephrophylla | |
| 絶滅危惧1A類 | B | シシアクチ | ヤブコウジ科 | Ardisia quinquegona | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ドウダンツツジ | ツツジ科 | Enkianthus perulatus | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ユキワリソウ | サクラソウ科 | Primula modesta | |
| 絶滅危惧1A類 | A | サクラソウ | サクラソウ科 | Primula sieboldii | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | シノノメソウ | リンドウ科 | Swertia swertopsis | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | イワザクラ | サクラソウ科 | Primula tosaensis | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | ヒイラギ | モクセイ科 | Osmanthus heterophyllus | |
| 絶滅危惧1A類 | A | チョウジソウ | キョウチクトウ科 | Amsonia elliptica | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | クサタチバナ | カガイモ科 | Cynanchuma scyrifolium | − |
| 絶滅危惧1A類 | B | サクララン | カガイモ科 | Hoya carnosa | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ハナシノブ | ハナシノブ科 | Polemonium kiushianum | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | ホタルカズラ | ムラサキ科 | Lithospermum zollingeri | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ヒロハヤマトウバナ | シソ科 | Clinopodium latifolium | |
| 絶滅危惧1A類 | B | ミズトラノオ | シソ科 | Eusteralis yatabeana | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | シロバナヤマジソ | シソ科 | Mosla japonica var.thymolifera | |
| 絶滅危惧1A類 | B | コナミキ | シソ科 | Scutellaria guilielmii | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | ケミヤマナミキ | シソ科 | Scutellaria shikokiana var.pubicaulis | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | イヌゴマ | シソ科 | Stachys riederi var.intermedia | |
| 絶滅危惧1A類 | B | ツクシコゴメグサ | ゴマノハグサ科 | Euphrasia multifolia | |
| 絶滅危惧1A類 | A | クモイコゴメグサ | ゴマノハグサ科 | Euphrasia multifolia ver.kirisimana | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ツクシトラノオ（ヒロハトラノオ） | ゴマノハグサ科 | Pseudolysimachion kiusianum | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | ゴマノハグサ | ゴマノハグサ科 | Scrophularia buergeriana | |
| 絶滅危惧1A類 | B | イヌノフグリ | ゴマノハグサ科 | Veronica polita var.lilacina | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | ナンゴククガイソウ | ゴマノハグサ科 | Veronicastrum japonicum var.australe | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ツクシクガイソウ | ゴマノハグサ科 | Veronicastrum sibiricum ver.zuccarinii | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | アリモリソウ | キツネノマゴ科 | Codonacanthus pauciflorus | |
| 絶滅危惧1A類 | B | リュウキュウアイ | キツネノマゴ科 | Strobilanthes cusia | |
| 絶滅危惧1A類 | A | オカウツボ | ハマウツボ科 | Orobanche caerulescens f.nipponica | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ヤマヒョウタンボク | スイカズラ科 | Lonicera mochidzukiana ver.nomurana | |
| 絶滅危惧1A類 | A | レンプクソウ | レンプクソウ科 | Adoxa moschatellina | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ツクシイワシャジン | キキョウ科 | Adenophora hatsushimae | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | C | サワギキョウ | キキョウ科 | Lobelia sessilifolia | |
| 絶滅危惧1A類 | A | キキョウ | キキョウ科 | Platycodon grandiflorum | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | カワラハハコ | キク科 | Anaphalis margaritacea ssp.yedoensis | − |
| 絶滅危惧1A類 | A | ヤハズハハコ | キク科 | Anaphalis sinica | |
| 絶滅危惧1A類 | B | イヌヨモギ | キク科 | Artemisia keiskeana | |
| 絶滅危惧1A類 | B | モリアザミ | キク科 | Cirsium dipsacolepis | |
| 絶滅危惧1A類 | B | シオン | キク科 | Aster tataricus | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | イワギク | キク科 | Dendranthema zawadskii | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | ウラギク | キク科 | Aster tripolium | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | アキノハハコグサ | キク科 | Gnaphalium hypoleucum | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | ヤナギノギク | キク科 | Heteropappus hispidus ssp.leptocladus | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | チョウセンスイラン | キク科 | Hololeion maximowiczii | |
| 絶滅危惧1A類 | A | タカサゴソウ | キク科 | Ixeris chinensis ssp.strigosa | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | ミズギク | キク科 | Inula ciliaris | |
| 絶滅危惧1A類 | B | ホソバニガナ | キク科 | Ixeris makinoana | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | ユウガギクの一種 | キク科 | Kalimeris sp. | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ウスユキソウ | キク科 | Leontopodium japonicum | |
| 絶滅危惧1A類 | A | アソタカラコウ | キク科 | Ligularia fischeri var.takeyukii | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | キオン | キク科 | Senecio nemorensis | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ツクシタンポポ | キク科 | Taraxacum kiushianum | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | ヤンバルヒゴダイ | キク科 | Vernonia cinerea | |
| 絶滅危惧1A類 | B | スブタ | トチカガミ科 | Blyxa ceratosperma | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | ミカワスブタ | トチカガミ科 | Blyxa leiosperma | |
| 絶滅危惧1A類 | B | ウミヒルモ | トチカガミ科 | Halophila ovalis | 情報不足 |
| 絶滅危惧1A類 | B | センニンモ | ヒルムシロ科 | Potamogeton maackianus | |
| 絶滅危惧1A類 | B | リュウノヒゲモ | ヒルムシロ科 | Potamogeton pectinatus | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | カワツルモ | ヒルムシロ科 | Ruppia rostellata | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | アマモ | アマモ科 | Zostera marina | |
| 絶滅危惧1A類 | B | サガミトリゲモ | イバラモ科 | Najas indica | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | イトトリゲモ | イバラモ科 | Najas japonica | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | カンザシギボウシ | ユリ科 | Hosta capitata | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ウバタケギボウシ | ユリ科 | Hosta pulchella | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | ヒメユリ | ユリ科 | Lilium concolor var.partheneioni | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | ホソバノアマナ | ユリ科 | Lloydia triflora | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ミドリヨウラク | ユリ科 | Polygonatum inflatum | |
| 絶滅危惧1A類 | B | ミヤマナルコユリ | ユリ科 | Polygonatum lasianthum | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ミヤマゼキショウ | ユリ科 | Tofieldia coccinea var.kiusiana | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | ハナゼキショウ | ユリ科 | Tofieldia nuda | |
| 絶滅危惧1A類 | A | エヒメアヤメ | アヤメ科 | Iris rossii | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | シロシャクジョウ | ヒナノシャクジョウ科 | Burmannia cryptopetala | |
| 絶滅危惧1A類 | B | ハナビゼキショウ | イグサ科 | Juncus alatus | |
| 絶滅危惧1A類 | A | タカナベイ（南谷新称） | イグサ科 | Juncus sp. | |
| 絶滅危惧1A類 | A | イヌイ（ヒライ、ネジレイ） | イグサ科 | Juncus yokoscensis | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ホウキボシイヌノヒゲ（南谷新称） | ホシクサ科 | Eriocaulon sp. | |
| 絶滅危惧1A類 | A | エダウチシロホシクサ（南谷新称） | ホシクサ科 | Eriocaulon sp. | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ゴマシオホシクサ | ホシクサ科 | Eriocaulon senile | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ヒメコヌカグサ | イネ科 | Agrostis nipponensis | 準絶滅危惧 |
| 絶滅危惧1A類 | B | コメガヤ | イネ科 | Melica nutans | |
| 絶滅危惧1A類 | B | イブキヌカボ | イネ科 | Milium effusum | − |
| 絶滅危惧1A類 | A | ヒュウガヒロハテンナンショウ | サトイモ科 | Arisaema minamitanii | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | ヒンジモ | ウキクサ科 | Lemna trisulca var.sagittata | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | ヒメミクリ | ミクリ科 | Sparganium stenophyllum | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | ビロードスゲ | カヤツリグサ科 | Carex fedia var.miyabei | |
| 絶滅危惧1A類 | B | ウマスゲ | カヤツリグサ科 | Carex idzuroei | |
| 絶滅危惧1A類 | A | オニナルコスゲ | カヤツリグサ科 | Carex vesicaria | |
| 絶滅危惧1A類 | B | スジヌマハリイ | カヤツリグサ科 | Eleocharis equisetiformis | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | セイタカハリイ | カヤツリグサ科 | Eleocharis attenuata | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ミスミイ | カヤツリグサ科 | Eleocharis fistulosa | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | チャボイ | カヤツリグサ科 | Eleocharis parvula | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | オノエテンツキ | カヤツリグサ科 | Ｆimbristylis fusca | |
| 絶滅危惧1A類 | A | コアゼテンツキ | カヤツリグサ科 | Ｆimbristylis aestivakis | |
| 絶滅危惧1A類 | C | ナガボテンツキ | カヤツリグサ科 | Ｆimbristylis longispica | |
| 絶滅危惧1A類 | B | ノハラテンツキ | カヤツリグサ科 | Ｆimbristylis miliacea | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | ミクリガヤ | カヤツリグサ科 | Rhynchospora malasica | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | コマツカサススキ | カヤツリグサ科 | Scirpus fuirenoides | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ウキヤガラ | カヤツリグサ科 | Bolboschoenus fluviatilis | |
| 絶滅危惧1A類 | A | オトマスカンガレイ（乙益、南谷新称） | カヤツリグサ科 | Scirpus sp. | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ヒロハノカラン（ダルマエビネ） | ラン科 | Calanthe japonica | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | ササバギンラン | ラン科 | Cephalanthera longibracteata | |
| 絶滅危惧1A類 | A | タネガシマカイロラン | ラン科 | Cheirostylis liukiuensis | |
| 絶滅危惧1A類 | B | ベニシュスラン | ラン科 | Goodyera macrantha | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ノビネチドリ | ラン科 | Gymnadenia camtschatica | |
| 絶滅危惧1A類 | A | ヒゲナガトンボ | ラン科 | Habenaria flagellifera var.yosiei | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | イヨトンボ | ラン科 | Habenaria iyoensis | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | タコガタサギソウ（ヒュウガトンボ） | ラン科 | Habenaria lacertifera var.triangularis | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | フガクスズムシソウ | ラン科 | Liparis fujisanensis | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | ササバラン | ラン科 | Liparis odorata | |
| 絶滅危惧1A類 | A | チケイラン | ラン科 | Liparis plicata | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | コフタバラン | ラン科 | Listera cordata var.japonica | |
| 絶滅危惧1A類 | B | ムカゴサイシン | ラン科 | Nervilia nipponica | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | オオバヨウラクラン | ラン科 | Oberonia variabilis | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | ウチョウラン | ラン科 | Orchis graminifolia | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | ソハヤキトンボ | ラン科 | Platanthera stenoglossa ssp.hottae | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1A類 | A | マイサギソウ | ラン科 | Platanthera mandarinorum var.neglecta | |
| 絶滅危惧1A類 | B | ナガバノキソチドリ | ラン科 | Platanthera ophrydioides var.australis | |
| 絶滅危惧1A類 | B | トキソウ | ラン科 | Pogonia japonica | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1A類 | B | マツラン | ラン科 | Saccolabium matsuran | |
| 絶滅危惧1A類 | B | ムカデラン | ラン科 | Sarcanthus scolopendrifolius | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1A類 | ヤクシマネッタイラン | ラン科 | Tropidia nipponica | 絶滅危惧1B類 | |
| 絶滅危惧1A類 | B | キバナノショウキラン | ラン科 | Yoania amagiensis | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1B類 | B | スギラン | ヒカゲノカズラ科 | Lycopodium cryptomerinum | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1B類 | B | チチブホラゴケ | コケシノブ科 | Lacosteopsis titibuensis | |
| 絶滅危惧1B類 | B | リュウキュウコケシノブ | コケシノブ科 | Mecodium riukiuense | |
| 絶滅危惧1B類 | B | クサマルハチ | ヘゴ科 | Cyathea hancockii | |
| 絶滅危惧1B類 | A | オオタニワタリ | チャセンシダ科 | Asplenium antiquum | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1B類 | A | シモツケヌリトラノオ | チャセンシダ科 | Asplenium normale var.boreale | |
| 絶滅危惧1B類 | B | イチョウシダ | チャセンシダ科 | Asplenium ruta-muraria | |
| 絶滅危惧1B類 | C | チャセンシダ | チャセンシダ科 | Asplenium trichomanes | |
| 絶滅危惧1B類 | B | イヌタマシダ | オシダ科 | Dryopteris hayatae | |
| 絶滅危惧1B類 | B | タニヘゴ | オシダ科 | Dryopteris tokyoensis | |
| 絶滅危惧1B類 | A | チャボイノデ | オシダ科 | Polystichum igaense | |
| 絶滅危惧1B類 | B | オオキヨズミシダ | オシダ科 | Polystichum tsus-simense var.mayebarae | |
| 絶滅危惧1B類 | B | ヒメシダ | ヒメシダ科 | Thelypteris palustris | |
| 絶滅危惧1B類 | A | シイバサトメシダ | イワデンダ科 | Athyrium sohayakiense | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1B類 | C | ハコネシケチシダ | イワデンダ科 | Cornopteris hakonensis | |
| 絶滅危惧1B類 | B | フモトシケシダ | イワデンダ科 | Deparia pseudo-conilii | |
| 絶滅危惧1B類 | B | ヒロハノコギリシダ | イワデンダ科 | Diplazium dilatatum | − |
| 絶滅危惧1B類 | B | イヨクジャク | イワデンダ科 | Diplazium okudairae | |
| 絶滅危惧1B類 | B | ホテイシダ | ウラボシ科 | Lepisorus annuifrons | |
| 絶滅危惧1B類 | B | コウラボシ | ウラボシ科 | Leposorus uchiyamae | |
| 絶滅危惧1B類 | B | ヌカボタデ | タデ科 | Persicaria taquetii | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1B類 | A | アズマイチゲ | キンポウゲ科 | Anemone raddeana | |
| 絶滅危惧1B類 | B | オキナグサ | キンポウゲ科 | Pulsatilla cernua | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1B類 | A | ヘビノボラズ | メギ科 | Berberis sieboldii | |
| 絶滅危惧1B類 | B | オグラコウホネ | スイレン科 | Nuphar oguraense | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1B類 | C | ヒツジグサ | スイレン科 | Nymphaea tetragona var.angusta | |
| 絶滅危惧1B類 | A | ヤッコソウ | ラフレシア科 | Mitrastemon yamamotoi | |
| 絶滅危惧1B類 | A | ナガバノイシモチソウ | モウセンゴケ科 | Drosera indica | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1B類 | C | ツクシキケマン | ケシ科 | Corydalis heterocarpa | |
| 絶滅危惧1B類 | B | ベンケイソウ | ベンケイソウ科 | Hylotelephium erythrostictum | |
| 絶滅危惧1B類 | A | チャボツメレンゲ | ベンケイソウ科 | Meterostachys sikokianus | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1B類 | B | ツメレンゲ | ベンケイソウ科 | Orostachys japonicus | 準絶滅危惧 |
| 絶滅危惧1B類 | A | コミノヒメウツギ（初島新称） | ユキノシタ科 | Deutzia gracilis var.microcarpa nom.nud. | |
| 絶滅危惧1B類 | B | ワタナベソウ | ユキノシタ科 | Peltoboykinia watanabei | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1B類 | A | オオバネムノキ | マメ科 | Albizia kalkora | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1B類 | A | レンリソウ | マメ科 | Lathyrus quinquenervius | − |
| 絶滅危惧1B類 | C | ヨツバハギ | マメ科 | Vicia nipponica | |
| 絶滅危惧1B類 | B | ヨコグラノキ | クロウメモドキ科 | Berchemia berchemiaefolia | |
| 絶滅危惧1B類 | A | ナリヒラモチ | モチノキ科 | Ilex kiusiana | |
| 絶滅危惧1B類 | A | クマガワブドウ | ブドウ科 | Vitis romanetii | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1B類 | B | サクラスミレ | スミレ科 | Viola hirtipes | |
| 絶滅危惧1B類 | C | フサモ | アリノトウグサ科 | Myriophyllum verticillatum | |
| 絶滅危惧1B類 | B | ハマゼリ | セリ科 | Cnidium japonicum | |
| 絶滅危惧1B類 | B | レンゲツツジ | ツツジ科 | Rhododendron japonicum | |
| 絶滅危惧1B類 | B | ヤナギイボタ | モクセイ科 | Ligustrum salicinum | |
| 絶滅危惧1B類 | B | ヒメナエ | マチン科 | Mitrasacme indica | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1B類 | B | ガガブタ | ミツガシワ科 | Nymphoides indica | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1B類 | A | ナンゴクカモメヅル | ガガイモ科 | Cynanchum austrokiusianum | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1B類 | B | イケマ | ガガイモ科 | Cynanchum caudatum | |
| 絶滅危惧1B類 | B | ツルモウリンカ | ガガイモ科 | Tylophora tanakae | |
| 絶滅危惧1B類 | A | マルバチシャノキ | ムラサキ科 | Ehretia dicksonii | |
| 絶滅危惧1B類 | C | イワカガミ | イワウメ科 | Schizocodon soldanelloides | |
| 絶滅危惧1B類 | C | カワミドリ | シソ科 | Agastache rugosa | |
| 絶滅危惧1B類 | B | ジャコウソウ | シソ科 | Chelonopsis moschata | |
| 絶滅危惧1B類 | C | キセワタ | シソ科 | Leonurus macranthus | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1B類 | B | シロネ | シソ科 | Lycopus lucidus | |
| 絶滅危惧1B類 | B | ヤマウツボ | ゴマノハグサ科 | Lathraea japonica | |
| 絶滅危惧1B類 | A | シシンラン | イワタバコ科 | Lysionotus pauciflorus | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1B類 | B | オケラ | キク科 | Atractylodes japonica | |
| 絶滅危惧1B類 | B | ヒナヒゴタイ | キク科 | Saussurea japonica | 情報不足 |
| 絶滅危惧1B類 | C | ヤナギスブタ | トチカガミ科 | Blyxa japonica | |
| 絶滅危惧1B類 | B | イトモ | ヒルムシロ科 | Potamogeton pusilla | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1B類 | C | オオトリゲモ | イバラモ科 | Najas oguraensis | |
| 絶滅危惧1B類 | B | キクバヤマボクチ | キク科 | Synurus palmatopinnatifidus | |
| 絶滅危惧1B類 | A | ホンゴウソウ | ホンゴウソウ科 | Sciaphila japonica | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1B類 | B | キジカクシ | ユリ科 | Asparagus schoberioides | |
| 絶滅危惧1B類 | B | チャボシライトソウ | ユリ科 | Chionographis koidzumiana | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1B類 | A | ササユリ | ユリ科 | Lilium japonicum | |
| 絶滅危惧1B類 | A | マルバサンキライ | ユリ科 | Smilax vaginata ver.stans | |
| 絶滅危惧1B類 | A | キバナノツキヌキホトトギス | ユリ科 | Tricyrtis perfoliata | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1B類 | B | エンレイソウ | ユリ科 | Trillium smallii | |
| 絶滅危惧1B類 | B | シロバナエンレイソウ | ユリ科 | Trillium tschonoskii | |
| 絶滅危惧1B類 | B | ヒナノシャクジョウ | ヒナノシャクジョウ科 | Burmannia championii | |
| 絶滅危惧1B類 | B | アマノホシクサ | ホシクサ科 | Eriocaulon amanoanum | 情報不足 |
| 絶滅危惧1B類 | A | クロイヌノヒゲモドキ | ホシクサ科 | Eriocaulon atroides | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1B類 | C | ヒナザサ | イネ科 | Coelachne japonica | |
| 絶滅危惧1B類 | A | ハラヌメリ | イネ科 | Sacciolepis myosuroides | |
| 絶滅危惧1B類 | B | マイヅルテンナンショウ | サトイモ科 | Arisaema heterophyllum | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1B類 | B | シコクヒロハテンナンショウ | サトイモ科 | Arisaema longipedunculatum | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1B類 | A | ツクシテンナンショウ | サトイモ科 | Arisaema ogatae | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1B類 | B | ミツバテンナンショウ | サトイモ科 | Arisaema ternatipartitum | |
| 絶滅危惧1B類 | B | ヤマトミクリ | ミクリ科 | Sparganium fallax | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1B類 | B | アワボスゲ | カヤツリグサ科 | Carex brownii | |
| 絶滅危惧1B類 | C | ノテンツキ | カヤツリグサ科 | Ｆimbristylis complanata | |
| 絶滅危惧1B類 | B | マツカサススキ | カヤツリグサ科 | Scirpus mitsukurianus | − |
| 絶滅危惧1B類 | C | コウキヤガラ | カヤツリグサ科 | Scirpus planiculmis | |
| 絶滅危惧1B類 | B | キリシマエビネ | ラン科 | Calanthe aristulifera var.kirishimensis | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1B類 | B | キエビネ | ラン科 | Calanthe sieboldii | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1B類 | B | サルメンエビネ | ラン科 | Calanthe tricarinata | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1B類 | A | オキナワチドリ | ラン科 | Amitostigma lepidum | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1B類 | B | マヤラン | ラン科 | Cymbidium nipponicum | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1B類 | B | クマガイソウ | ラン科 | Cypripedium japonicum | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1B類 | B | キバナノセッコク | ラン科 | Dendrobium tosaense | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1B類 | A | イモネヤガラ | ラン科 | Eulophia zollingeri | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1B類 | B | ダイサギソウ | ラン科 | Habenaria dentata | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧1B類 | B | ムカゴトンボ | ラン科 | Habenaria flagellifera | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1B類 | B | サギソウ | ラン科 | Habenaria radiata | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1B類 | B | ミズトンボ | ラン科 | Habenaria sagittifera | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧1B類 | B | クロムヨウラン | ラン科 | Lecanorchis nigricans | |
| 絶滅危惧1B類 | B | ニラバラン | ラン科 | Microtis unifolia | |
| 絶滅危惧1B類 | B | ガンゼキラン | ラン科 | Phaius flavus | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1B類 | C | ツレサギソウ | ラン科 | Platanthera japonica | |
| 絶滅危惧1B類 | B | オオヤマサギソウ | ラン科 | Platanthera sachalinensis | − |
| 絶滅危惧1B類 | B | ナゴラン | ラン科 | Sedirea japonica | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧1B類 | B | ヒトツボクロ | ラン科 | Tipularia japonica | |
| 絶滅危惧1B類 | B | キヌラン | ラン科 | Zeuxine strateumatica | |
| 絶滅危惧2類 | B | マツバラン | マツバラン科 | Psilotum nudum | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧2類 | B | ヒモラン | ヒカゲノカズラ科 | Lycopodium sieboldii | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧2類 | B | ヘゴ | ヘゴ科 | Cyathea spinulosa | |
| 絶滅危惧2類 | C | テツホシダ | ヒメシダ科 | Cyclosorus interruptus | |
| 絶滅危惧2類 | A | カワラハンノキ | カバノキ科 | Alnus serrulatoides | |
| 絶滅危惧2類 | A | サクラバハンノキ | カバノキ科 | Alnus trabeculosa | 準絶滅危惧 |
| 絶滅危惧2類 | A | ウワバミソウ | イラクサ科 | Elatostema umbellatum var.majaus | |
| 絶滅危惧2類 | B | ヒメコウホネ | スイレン科 | Nuphar subintegerrimum | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧2類 | A | ヒュウガアジサイ | ユキノシタ科 | Hydrangea serrata var.minamitanii | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧2類 | A | ズイナ | ユキノシタ科 | Itea japonica | |
| 絶滅危惧2類 | A | キレンゲショウマ | ユキノシタ科 | Kirengeshoma palmata | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧2類 | C | タコノアシ | ユキノシタ科 | Penthorum chinense | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧2類 | B | ヤシャビシャク | ユキノシタ科 | Ribes ambiguum | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧2類 | B | ハカマカズラ | マメ科 | Lasiobema japonica | |
| 絶滅危惧2類 | B | イヌハギ | マメ科 | Lespedeza tomentosa | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧2類 | B | タチバナ | ミカン科 | Citrus tachibana | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧2類 | B | ハマナツメ | クロウメモドキ科 | Paliurus ramosissimus | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧2類 | B | ツクシシャクナゲ | ツツジ科 | Rhododendron degronianum ssp.metternichii | − |
| 絶滅危惧2類 | C | イヌセンブリ | リンドウ科 | Swertia diluta var.tosaensis | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧2類 | C | ヒメシロアサザ | ミツガシワ科 | Nymphoides coreana | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧2類 | C | ロクオンソウ | カガイモ科 | Cynanchum amplexicaule | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧2類 | C | フナバラソウ | ガガイモ科 | Cynanchum atratum | |
| 絶滅危惧2類 | C | スズサイコ | ガガイモ科 | Cynanchum paniculatum | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧2類 | A | ヒュウガトウキ | セリ科 | Angelica furcijuga | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧2類 | A | ヒュウガオオバセンキュウ（南谷新称） | セリ科 | Angelica sp. | |
| 絶滅危惧2類 | C | グンバイヒルガオ | ヒルガオ科 | Ipomoea pes-caprae | |
| 絶滅危惧2類 | C | ヤマジソ | シソ科 | Mosla japonica | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧2類 | C | ヒメナミキ | シソ科 | Scutellaria dependens | |
| 絶滅危惧2類 | C | ヒキヨモギ | ゴマノハグサ科 | Siphonostegia chinensis | |
| 絶滅危惧2類 | C | ハマクワガタ | ゴマノハグサ科 | Veronica javanica | |
| 絶滅危惧2類 | B | ノタヌキモ | タヌキモ科 | Utricularia aurea | |
| 絶滅危惧2類 | B | ホザキノミミカキグサ | タヌキモ科 | Utricularia caerulea | |
| 絶滅危惧2類 | C | ミカワタヌキモ | タヌキモ科 | Utricularia exoleta | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧2類 | B | ムラサキミミカキグサ | タヌキモ科 | Utricularia uliginosa | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧2類 | B | シバナ | ホロムイソウ科 | Triglochin asiaticum | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧2類 | A | ミズギボウシ | ユリ科 | Hosta longissima var.brevifolia | − |
| 絶滅危惧2類 | B | ツクシタチドコロ | ヤマノイモ科 | Dioscorea asclepiadea | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧2類 | B | キリシマシャクジョウ | ヒナノシャクジョウ科 | Burmannia liukiuensis | 絶滅危惧1A類 |
| 絶滅危惧2類 | B | ヒメコウガイゼキショウ | イグサ科 | Juncus bufonius | |
| 絶滅危惧2類 | B | ホソイ | イグサ科 | Juncus setchuensis var.effusoides | |
| 絶滅危惧2類 | B | ウンヌケモドキ | イネ科 | Eulalia quadrinervis | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧2類 | B | ミクリ | ミクリ科 | Sparganium erectum ssp.stoloniferum | 準絶滅危惧 |
| 絶滅危惧2類 | B | ツクシナルコ | カヤツリグサ科 | Carex subcernua | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧2類 | B | カガシラ | カヤツリグサ科 | Scleria caricina | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧2類 | B | ミカワシンジュガヤ | カヤツリグサ科 | Scleria mikawana | 絶滅危惧1B類 |
| 絶滅危惧2類 | C | シラン | ラン科 | Bletilla striata | 準絶滅危惧 |
| 絶滅危惧2類 | C | エビネ | ラン科 | Calanthe discolor | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧2類 | C | ナツエビネ | ラン科 | Calanthe reflexa | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧2類 | B | タシロラン | ラン科 | Epipogium roseum | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧2類 | B | ハルザキヤツシロラン | ラン科 | Gastrodia nipponica | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧2類 | B | フウラン | ラン科 | Neofinetia falcata | 絶滅危惧2類 |
| 絶滅危惧2類 | B | コバノトンボソウ | ラン科 | Platanthera tipuloides var.nipponica | |
| 絶滅危惧2類 | B | ヤクシマラン | ラン科 | Apostasia nipponica | 絶滅危惧2類 |
| 準絶滅危惧 | A | ヤシャゼンマイ | ゼンマイ科 | Osmunda lancea | |
| 準絶滅危惧 | B | ニセヨゴレイタチシダ | オシダ科 | Dryopteris hadanoi | 絶滅危惧2類 |
| 準絶滅危惧 | A | コウヤマキ | スギ科 | Sciadopitys verticillata | |
| 準絶滅危惧 | B | ハナガガシ | ブナ科 | Quercus hondae | 絶滅危惧1B類 |
| 準絶滅危惧 | B | ウバメガシ | ブナ科 | Quercus phillyraeoides | |
| 準絶滅危惧 | C | ハンノキ | カバノキ科 | Alnus japonica | |
| 準絶滅危惧 | A | ナガバサンショウソウ | イラクサ科 | Pellionia yosiei | 絶滅危惧1B類 |
| 準絶滅危惧 | B | キイレツチトリモチ | ツチトリモチ科 | Balanophora tobiracola | |
| 準絶滅危惧 | C | ミチヤナギ | タデ科 | Polygonum aviculare | |
| 準絶滅危惧 | C | コギシギシ | タデ科 | Rumex nipponicus | 絶滅危惧2類 |
| 準絶滅危惧 | C | タガラシ | キンポウゲ科 | Ranunculus sceleratus | |
| 準絶滅危惧 | C | コウホネ | スイレン科 | Nuphar japonicum | |
| 準絶滅危惧 | A | ギョボク | フウチョウソウ科 | Crataeva falcata | |
| 準絶滅危惧 | B | マルバコウツギ | ユキノシタ科 | Deutzia bungoensis | |
| 準絶滅危惧 | B | ハマボウ | アオイ科 | Hibiscus hamabo | |
| 準絶滅危惧 | C | ミズキカシグサ | ミソハギ科 | Rotala leptopetala var.littorea | 絶滅危惧1B類 |
| 準絶滅危惧 | A | ウラジロミツバツツジ | ツツジ科 | Rhododendron osuzuyamense | 絶滅危惧2類 |
| 準絶滅危惧 | C | ウマノスズクサ | ウマノスズクサ科 | Aristolochia debilis | |
| 準絶滅危惧 | C | ハマサジ | イソマツ科 | Limonium tetragonum | 絶滅危惧2類 |
| 準絶滅危惧 | C | ミズネコノオ | シソ科 | Eusteralis stellata | 絶滅危惧2類 |
| 準絶滅危惧 | C | ゴマクサ | ゴマノハグサ科 | Centranthera cochinchinensis ssp.lutea | 絶滅危惧1B類 |
| 準絶滅危惧 | B | マルバノサワトウガラシ | ゴマノハグサ科 | Deinostema adenocaulon | 絶滅危惧1B類 |
| 準絶滅危惧 | B | マルバテイショウソウ | キク科 | Ainsliaea fragrans var.integrifolia | 絶滅危惧1B類 |
| 準絶滅危惧 | B | モミジコウモリ | キク科 | Cacalia kiusiana | 絶滅危惧1B類 |
| 準絶滅危惧 | C | ミズオオバコ | トチカガミ科 | Ottelia japonica | |
| 準絶滅危惧 | C | セキショウモ | トチカガミ科 | Vallisneria asiatica | |
| 準絶滅危惧 | B | コアマモ | アマモ科 | Zostera japonica | 情報不足 |
| 準絶滅危惧 | A | キバナノホトトギス | ユリ科 | Tricyrtis flava | 絶滅危惧2類 |
| 準絶滅危惧 | C | オオホシクサ | ホシクサ科 | Eriocaulon buergerianum | |
| 準絶滅危惧 | C | ツクシクロイヌノヒゲ | ホシクサ科 | Eriocauron nakasimanum | 絶滅危惧2類 |
| 準絶滅危惧 | C | クロホシクサ | ホシクサ科 | Eriocaulon parvum | 絶滅危惧1B類 |
| 準絶滅危惧 | C | ナガエミクリ | ミクリ科 | Sparganium japonicum | 準絶滅危惧 |
| 準絶滅危惧 | B | イセウキヤガラ | カヤツリグサ科 | Bolboschoenus planiculmis | |
| 準絶滅危惧 | C | ムギラン | ラン科 | Bulbophyllum inconspicuum | 絶滅危惧2類 |
| 情報不足 | A | アカハナワラビ | ハナヤスリ科 | Botrychium nipponicum | |
| 情報不足 | B | ヤタケイワヘゴ | オシダ科 | Dryopteris otomasui | |
| 情報不足 | C | ホソバショリマ | ヒメシダ科 | Thelypteris beddomei | |
| 情報不足 | A | コメツガ | マツ科 | Tsuga diversifolia | |
| 情報不足 | C | コウモリカズラ | ツヅラフジ科 | Menispermum dauricum | |
| 情報不足 | C | クロイチゴ | バラ科 | Rubus mesogaeus | |
| 情報不足 | B | オニビシ | ヒシ科 | Trapa natans var.japonica | |
| 情報不足 | B | クマノダケ | セリ科 | Angelica mayebarana | |
| 情報不足 | C | ハマネナシカズラ | ヒルガオ科 | Cuscuta chinensis | |
| 情報不足 | B | ヒメサギゴケ | ゴマノハグサ科 | Mazus goodenifolius | 情報不足 |
| 情報不足 | B | トチカガミ | トチカガミ科 | Hydrocharis dubia | |
| 情報不足 | C | ケクサスゲ（ケヒエスゲ） | カヤツリグサ科 | Carex mayebarana | |
| 情報不足 | C | ジングウスゲ | カヤツリグサ科 | Carex sacrosancta | 絶滅危惧2類 |
| 情報不足 | B | クロミノハリイ | カヤツリグサ科 | Eleocharis atropurpurea | 絶滅危惧1A類 |
| 情報不足 | B | アオスズラン | ラン科 | Epipactis papillosa | |
| 情報不足 | B | ヒメトケンラン | ラン科 | Tainia laxiflora | 絶滅危惧1B類 |
| 情報不足 | B | トキリマメ | マメ科 | Rhynchosia acuminatifolia | |
| 情報不足 | B | クロヤツシロラン | ラン科 | Gastrodia pubilabiata | 絶滅危惧1B類 |
| その他保護上重要な種 | A | ソテツ | ソテツ科 | Cycas revoluta | |
| その他保護上重要な種 | A | キリシマミズキ | マンサク科 | Corylopsis glabrescens | 絶滅危惧2類 |
| その他保護上重要な種 | A | ツクシコメツツジ（南谷新称） | ツツジ科 | Rhododendron sp. | |
| その他保護上重要な種 | B | キリシマミツバツツジ | ツツジ科 | Rhododendron nudipes var.kirishimense | 絶滅危惧2類 |
| その他保護上重要な種 | A | ツクシアケボノツツジ | ツツジ科 | Rhododendron pentaphyllum var.pentapyullum | 絶滅危惧2類 |
| その他保護上重要な種 | B | ビロウ | ヤシ科 | Livistona subglobosa | |
| その他保護上重要な種 | B | 綾南川のクサソテツ | イワデンダ科 | Matteuccia struthiopteris | |
| その他保護上重要な種 | B | 霧島山麓のツクシシオガマ | ゴマノハグサ科 | Pedicularis refracta | − |