ウイルスや細菌を原因とする感染症について、病原体や抗体保有状況のモニタリングを行い、予防や診断に役立つ情報を提供しています。

新型インフルエンザや麻しん、レジオネラ症などの感染症の流行に際しては、病原体の確定を行っています。

また、これらの業務に役立つ調査・研究や技術指導も実施しています。

食中毒発生時の原因究明の為の細菌学的試験を行っています。また、食品、飲料水、海水浴場水、工場排水などの細菌試験を行い、これらの安全性確保に努めています。